bar + errorbar

http://www.mathworks.co.jp/support/solutions/ja/data/1-9J8S0T/index.html?product=ML&solution=1-9J8S0Tより抜粋。

BAR 関数で棒グラフを描画し、ハンドルから棒グラフの左端と右端の X 座標を取得して中心値を計算し、中心値に対して ERRORBAR 関数で描画します。
具体的には、下記の手順で行なえます。

1. bar 関数で棒グラフを描画（このとき、出力引数を付けてハンドルを取得）
2. 上記 1 で得られたハンドル各棒グラフの X 座標値を取得し、各棒グラフの
　　 中心座標を計算
3. 上記 2 で計算した X 座標を使用し、 errorbar 関数でエラーバーを描画

以下に例を示します。

% データ定義
Y = round(rand(5,3)*10); % グループ数 3、標本数 5
e = std(Y); % 標準偏差の計算

% 棒グラフの描画
figure, h = bar(Y,'hist'); % ハンドルを取得
hold on

[numgroups, numbars] = size(Y); % numgroups: グループ数, numbars: 標本数

% 各棒グラフのX座標値を取得
xdata = get(h,'XData'); % 出力はセル配列
% X座標から各棒グラフの中心座標を計算
centerX = cellfun(@(x)(x(1,:)+x(3,:))/2,xdata,'UniformOutput', false);

E = repmat(e,numgroups,1); % グラフ表示用にデータを拡張
C = {'b','g','r'}; % エラーバーの色

% 標準偏差を棒グラフに重ねて描画
for i = 1:numbars
errorbar(centerX{i,:}, Y(:,i), E(:,i), C{i},...
'linestyle', 'none','LineWidth',2);
end

なお、このプログラムでは、グループ毎に標準偏差の色分けを行い、さらに ERRORBAR 関数の各点を結ぶ線を非表示にしてプロットしています。
各点を結ぶ線を消すには、出力引数を付けて ERRORBAR 関数を実行後、'LineStyle' プロパティに 'None' を設定します。

また、プログラム内では、各棒グラフの X座標の中心座標を計算する際に、CELLFUN 関数を使用しています。この関数の機能については、関連ソリューションをご覧下さい。